Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms