Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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AP3B2Q13367 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
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