Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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SGCGQ13326 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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SGCGQ13326 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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SGCGQ13326 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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SGCGQ13326 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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SGCGQ13326 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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SGCGQ13326 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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SGCGQ13326 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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SGCGQ13326 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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SGCGQ13326 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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SGCGQ13326 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SGCGQ13326 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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