Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EP300Q09472 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EP300Q09472 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EP300Q09472 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EP300Q09472 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EP300Q09472 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EP300Q09472 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EP300Q09472 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EP300Q09472 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EP300Q09472 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EP300Q09472 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EP300Q09472 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EP300Q09472 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EP300Q09472 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EP300Q09472 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EP300Q09472 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EP300Q09472 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EP300Q09472 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EP300Q09472 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EP300Q09472 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EP300Q09472 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EP300Q09472 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EP300Q09472 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
EP300Q09472 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EP300Q09472 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EP300Q09472 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EP300Q09472 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EP300Q09472 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EP300Q09472 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EP300Q09472 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EP300Q09472 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EP300Q09472 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EP300Q09472 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EP300Q09472 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EP300Q09472 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EP300Q09472 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EP300Q09472 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EP300Q09472 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EP300Q09472 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EP300Q09472 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EP300Q09472 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EP300Q09472 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EP300Q09472 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EP300Q09472 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EP300Q09472 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EP300Q09472 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EP300Q09472 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EP300Q09472 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EP300Q09472 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EP300Q09472 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EP300Q09472 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
EP300Q09472 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EP300Q09472 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EP300Q09472 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
EP300Q09472 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EP300Q09472 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
EP300Q09472 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EP300Q09472 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EP300Q09472 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EP300Q09472 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EP300Q09472 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EP300Q09472 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EP300Q09472 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EP300Q09472 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
EP300Q09472 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EP300Q09472 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EP300Q09472 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EP300Q09472 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EP300Q09472 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
EP300Q09472 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EP300Q09472 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EP300Q09472 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EP300Q09472 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EP300Q09472 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EP300Q09472 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EP300Q09472 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EP300Q09472 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
EP300Q09472 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EP300Q09472 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EP300Q09472 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EP300Q09472 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EP300Q09472 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
EP300Q09472 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
EP300Q09472 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EP300Q09472 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EP300Q09472 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EP300Q09472 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EP300Q09472 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EP300Q09472 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EP300Q09472 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EP300Q09472 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EP300Q09472 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EP300Q09472 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EP300Q09472 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EP300Q09472 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EP300Q09472 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EP300Q09472 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EP300Q09472 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EP300Q09472 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
EP300Q09472 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms