Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
LOXL1Q08397 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms