Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CXCL9Q07325 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms