Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms