Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TFAMQ00059 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TFAMQ00059 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms