Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX1P78337 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX1P78337 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX1P78337 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX1P78337 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX1P78337 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX1P78337 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX1P78337 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX1P78337 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX1P78337 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX1P78337 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX1P78337 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX1P78337 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX1P78337 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX1P78337 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX1P78337 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX1P78337 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX1P78337 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX1P78337 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX1P78337 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX1P78337 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX1P78337 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX1P78337 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX1P78337 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX1P78337 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX1P78337 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX1P78337 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX1P78337 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX1P78337 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX1P78337 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX1P78337 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX1P78337 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX1P78337 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX1P78337 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
PITX1P78337 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX1P78337 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX1P78337 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX1P78337 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX1P78337 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX1P78337 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX1P78337 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX1P78337 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX1P78337 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX1P78337 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX1P78337 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX1P78337 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX1P78337 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX1P78337 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX1P78337 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX1P78337 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX1P78337 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX1P78337 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX1P78337 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX1P78337 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX1P78337 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX1P78337 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX1P78337 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX1P78337 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX1P78337 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX1P78337 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX1P78337 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX1P78337 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX1P78337 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX1P78337 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX1P78337 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX1P78337 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX1P78337 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX1P78337 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX1P78337 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX1P78337 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX1P78337 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX1P78337 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX1P78337 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX1P78337 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX1P78337 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX1P78337 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX1P78337 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX1P78337 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX1P78337 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX1P78337 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX1P78337 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX1P78337 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX1P78337 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX1P78337 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX1P78337 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX1P78337 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX1P78337 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX1P78337 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PITX1P78337 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX1P78337 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX1P78337 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX1P78337 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX1P78337 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX1P78337 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX1P78337 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX1P78337 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX1P78337 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX1P78337 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX1P78337 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX1P78337 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms