Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms