Protein–RNA interactions for Protein: P56747

CLDN6, Claudin-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN6P56747 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN6P56747 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN6P56747 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN6P56747 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN6P56747 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN6P56747 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN6P56747 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN6P56747 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN6P56747 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN6P56747 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN6P56747 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN6P56747 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN6P56747 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN6P56747 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN6P56747 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN6P56747 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN6P56747 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN6P56747 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN6P56747 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN6P56747 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN6P56747 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN6P56747 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN6P56747 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN6P56747 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN6P56747 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN6P56747 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN6P56747 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN6P56747 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN6P56747 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN6P56747 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN6P56747 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN6P56747 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN6P56747 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN6P56747 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CLDN6P56747 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN6P56747 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CLDN6P56747 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN6P56747 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN6P56747 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CLDN6P56747 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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CLDN6P56747 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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CLDN6P56747 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN6P56747 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN6P56747 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN6P56747 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN6P56747 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN6P56747 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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CLDN6P56747 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN6P56747 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN6P56747 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN6P56747 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN6P56747 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN6P56747 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN6P56747 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN6P56747 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN6P56747 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN6P56747 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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