Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms