Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAD23BP54727 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms