Protein–RNA interactions for Protein: P52747

ZNF143, Zinc finger protein 143, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF143P52747 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ZNF143P52747 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms