Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DAP3P51398 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DAP3P51398 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DAP3P51398 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DAP3P51398 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DAP3P51398 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DAP3P51398 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DAP3P51398 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DAP3P51398 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DAP3P51398 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DAP3P51398 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DAP3P51398 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DAP3P51398 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DAP3P51398 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DAP3P51398 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DAP3P51398 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DAP3P51398 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DAP3P51398 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DAP3P51398 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DAP3P51398 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DAP3P51398 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
DAP3P51398 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DAP3P51398 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
DAP3P51398 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DAP3P51398 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DAP3P51398 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DAP3P51398 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DAP3P51398 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DAP3P51398 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DAP3P51398 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DAP3P51398 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DAP3P51398 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DAP3P51398 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DAP3P51398 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DAP3P51398 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DAP3P51398 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
DAP3P51398 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DAP3P51398 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DAP3P51398 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DAP3P51398 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DAP3P51398 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DAP3P51398 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DAP3P51398 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DAP3P51398 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DAP3P51398 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DAP3P51398 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DAP3P51398 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DAP3P51398 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DAP3P51398 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DAP3P51398 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DAP3P51398 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DAP3P51398 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DAP3P51398 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DAP3P51398 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
DAP3P51398 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
DAP3P51398 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DAP3P51398 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DAP3P51398 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DAP3P51398 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DAP3P51398 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DAP3P51398 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DAP3P51398 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DAP3P51398 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DAP3P51398 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DAP3P51398 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DAP3P51398 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DAP3P51398 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DAP3P51398 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DAP3P51398 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DAP3P51398 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
DAP3P51398 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DAP3P51398 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DAP3P51398 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DAP3P51398 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DAP3P51398 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DAP3P51398 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
DAP3P51398 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DAP3P51398 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
DAP3P51398 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
DAP3P51398 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DAP3P51398 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DAP3P51398 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
DAP3P51398 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DAP3P51398 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DAP3P51398 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DAP3P51398 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DAP3P51398 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DAP3P51398 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DAP3P51398 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DAP3P51398 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DAP3P51398 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DAP3P51398 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DAP3P51398 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DAP3P51398 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DAP3P51398 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
DAP3P51398 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DAP3P51398 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DAP3P51398 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DAP3P51398 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DAP3P51398 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms