Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK1EP49674 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CSNK1EP49674 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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