Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FNTAP49354 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FNTAP49354 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FNTAP49354 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNTAP49354 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FNTAP49354 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FNTAP49354 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FNTAP49354 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FNTAP49354 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FNTAP49354 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNTAP49354 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNTAP49354 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNTAP49354 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FNTAP49354 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNTAP49354 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FNTAP49354 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FNTAP49354 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNTAP49354 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNTAP49354 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FNTAP49354 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FNTAP49354 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNTAP49354 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNTAP49354 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNTAP49354 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNTAP49354 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNTAP49354 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNTAP49354 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNTAP49354 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNTAP49354 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNTAP49354 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNTAP49354 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNTAP49354 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNTAP49354 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNTAP49354 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNTAP49354 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNTAP49354 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNTAP49354 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNTAP49354 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNTAP49354 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNTAP49354 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNTAP49354 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNTAP49354 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNTAP49354 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNTAP49354 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNTAP49354 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNTAP49354 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNTAP49354 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FNTAP49354 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNTAP49354 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FNTAP49354 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNTAP49354 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNTAP49354 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNTAP49354 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNTAP49354 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNTAP49354 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FNTAP49354 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNTAP49354 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNTAP49354 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNTAP49354 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNTAP49354 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FNTAP49354 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNTAP49354 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNTAP49354 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNTAP49354 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNTAP49354 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNTAP49354 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNTAP49354 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNTAP49354 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNTAP49354 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNTAP49354 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNTAP49354 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNTAP49354 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNTAP49354 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNTAP49354 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNTAP49354 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNTAP49354 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNTAP49354 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNTAP49354 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNTAP49354 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNTAP49354 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FNTAP49354 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNTAP49354 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNTAP49354 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNTAP49354 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNTAP49354 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNTAP49354 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNTAP49354 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNTAP49354 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNTAP49354 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNTAP49354 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNTAP49354 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FNTAP49354 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNTAP49354 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNTAP49354 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNTAP49354 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNTAP49354 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNTAP49354 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNTAP49354 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNTAP49354 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FNTAP49354 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms