Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC11A1P49279 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms