Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX1P48742 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX1P48742 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX1P48742 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX1P48742 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX1P48742 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX1P48742 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX1P48742 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX1P48742 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX1P48742 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX1P48742 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX1P48742 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX1P48742 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX1P48742 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX1P48742 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX1P48742 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX1P48742 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX1P48742 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX1P48742 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX1P48742 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX1P48742 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX1P48742 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX1P48742 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX1P48742 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX1P48742 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX1P48742 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX1P48742 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX1P48742 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX1P48742 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX1P48742 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX1P48742 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX1P48742 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX1P48742 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX1P48742 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX1P48742 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX1P48742 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX1P48742 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX1P48742 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX1P48742 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX1P48742 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX1P48742 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX1P48742 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX1P48742 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX1P48742 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX1P48742 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX1P48742 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX1P48742 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX1P48742 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX1P48742 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX1P48742 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX1P48742 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX1P48742 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX1P48742 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX1P48742 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX1P48742 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX1P48742 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX1P48742 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX1P48742 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX1P48742 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX1P48742 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX1P48742 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX1P48742 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX1P48742 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX1P48742 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX1P48742 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX1P48742 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX1P48742 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX1P48742 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX1P48742 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX1P48742 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX1P48742 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX1P48742 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX1P48742 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX1P48742 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX1P48742 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX1P48742 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX1P48742 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX1P48742 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX1P48742 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX1P48742 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX1P48742 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX1P48742 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX1P48742 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX1P48742 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX1P48742 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX1P48742 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX1P48742 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX1P48742 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX1P48742 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX1P48742 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX1P48742 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX1P48742 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX1P48742 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX1P48742 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX1P48742 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX1P48742 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX1P48742 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX1P48742 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX1P48742 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX1P48742 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms