Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
RECQLP46063 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RECQLP46063 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RECQLP46063 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RECQLP46063 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RECQLP46063 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RECQLP46063 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RECQLP46063 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RECQLP46063 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RECQLP46063 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RECQLP46063 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RECQLP46063 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RECQLP46063 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RECQLP46063 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RECQLP46063 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RECQLP46063 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RECQLP46063 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RECQLP46063 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RECQLP46063 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RECQLP46063 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RECQLP46063 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RECQLP46063 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RECQLP46063 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RECQLP46063 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RECQLP46063 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RECQLP46063 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RECQLP46063 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RECQLP46063 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RECQLP46063 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RECQLP46063 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RECQLP46063 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RECQLP46063 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RECQLP46063 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RECQLP46063 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RECQLP46063 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RECQLP46063 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RECQLP46063 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RECQLP46063 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RECQLP46063 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RECQLP46063 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RECQLP46063 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RECQLP46063 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RECQLP46063 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RECQLP46063 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RECQLP46063 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RECQLP46063 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RECQLP46063 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RECQLP46063 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RECQLP46063 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RECQLP46063 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RECQLP46063 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RECQLP46063 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RECQLP46063 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RECQLP46063 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RECQLP46063 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RECQLP46063 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RECQLP46063 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RECQLP46063 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RECQLP46063 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RECQLP46063 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RECQLP46063 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RECQLP46063 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RECQLP46063 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RECQLP46063 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RECQLP46063 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RECQLP46063 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RECQLP46063 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RECQLP46063 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RECQLP46063 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RECQLP46063 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RECQLP46063 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RECQLP46063 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RECQLP46063 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RECQLP46063 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RECQLP46063 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RECQLP46063 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RECQLP46063 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RECQLP46063 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RECQLP46063 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RECQLP46063 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RECQLP46063 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RECQLP46063 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RECQLP46063 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RECQLP46063 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RECQLP46063 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RECQLP46063 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RECQLP46063 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RECQLP46063 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RECQLP46063 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RECQLP46063 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RECQLP46063 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RECQLP46063 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RECQLP46063 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RECQLP46063 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RECQLP46063 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RECQLP46063 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RECQLP46063 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RECQLP46063 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RECQLP46063 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RECQLP46063 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms