Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms