Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHKA1P46020 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms