Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETV4P43268 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETV4P43268 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETV4P43268 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETV4P43268 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV4P43268 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV4P43268 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV4P43268 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV4P43268 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV4P43268 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV4P43268 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV4P43268 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV4P43268 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV4P43268 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV4P43268 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV4P43268 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV4P43268 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV4P43268 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV4P43268 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV4P43268 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV4P43268 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV4P43268 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV4P43268 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV4P43268 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV4P43268 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV4P43268 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV4P43268 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV4P43268 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV4P43268 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV4P43268 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV4P43268 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV4P43268 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV4P43268 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV4P43268 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV4P43268 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV4P43268 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV4P43268 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV4P43268 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV4P43268 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV4P43268 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV4P43268 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV4P43268 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV4P43268 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV4P43268 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV4P43268 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV4P43268 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV4P43268 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV4P43268 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV4P43268 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV4P43268 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV4P43268 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETV4P43268 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV4P43268 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV4P43268 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV4P43268 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV4P43268 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV4P43268 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV4P43268 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV4P43268 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV4P43268 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV4P43268 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV4P43268 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV4P43268 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV4P43268 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV4P43268 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV4P43268 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV4P43268 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV4P43268 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV4P43268 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV4P43268 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV4P43268 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV4P43268 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV4P43268 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV4P43268 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV4P43268 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV4P43268 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV4P43268 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV4P43268 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV4P43268 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV4P43268 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV4P43268 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV4P43268 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV4P43268 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV4P43268 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV4P43268 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV4P43268 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV4P43268 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV4P43268 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV4P43268 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV4P43268 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV4P43268 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV4P43268 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV4P43268 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV4P43268 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV4P43268 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV4P43268 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV4P43268 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV4P43268 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV4P43268 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ETV4P43268 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132 ms