Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
KDM5AP29375 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDM5AP29375 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDM5AP29375 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDM5AP29375 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDM5AP29375 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDM5AP29375 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDM5AP29375 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDM5AP29375 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDM5AP29375 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDM5AP29375 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KDM5AP29375 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDM5AP29375 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KDM5AP29375 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDM5AP29375 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KDM5AP29375 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDM5AP29375 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDM5AP29375 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDM5AP29375 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KDM5AP29375 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDM5AP29375 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDM5AP29375 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDM5AP29375 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KDM5AP29375 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDM5AP29375 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KDM5AP29375 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDM5AP29375 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDM5AP29375 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDM5AP29375 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDM5AP29375 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDM5AP29375 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDM5AP29375 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDM5AP29375 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDM5AP29375 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDM5AP29375 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDM5AP29375 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDM5AP29375 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDM5AP29375 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDM5AP29375 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDM5AP29375 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KDM5AP29375 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDM5AP29375 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms