Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

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Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MMP11P24347 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MMP11P24347 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MMP11P24347 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MMP11P24347 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MMP11P24347 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MMP11P24347 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MMP11P24347 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MMP11P24347 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MMP11P24347 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MMP11P24347 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MMP11P24347 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MMP11P24347 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MMP11P24347 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MMP11P24347 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MMP11P24347 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MMP11P24347 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MMP11P24347 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MMP11P24347 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MMP11P24347 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MMP11P24347 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MMP11P24347 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MMP11P24347 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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MMP11P24347 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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MMP11P24347 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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MMP11P24347 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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MMP11P24347 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MMP11P24347 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
MMP11P24347 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MMP11P24347 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MMP11P24347 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
MMP11P24347 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MMP11P24347 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MMP11P24347 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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