Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms