Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFTRP13569 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFTRP13569 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFTRP13569 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFTRP13569 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFTRP13569 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CFTRP13569 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFTRP13569 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CFTRP13569 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFTRP13569 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFTRP13569 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFTRP13569 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFTRP13569 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFTRP13569 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFTRP13569 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFTRP13569 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFTRP13569 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFTRP13569 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFTRP13569 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFTRP13569 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFTRP13569 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFTRP13569 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFTRP13569 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFTRP13569 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFTRP13569 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFTRP13569 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFTRP13569 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFTRP13569 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFTRP13569 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFTRP13569 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFTRP13569 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFTRP13569 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFTRP13569 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFTRP13569 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFTRP13569 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFTRP13569 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFTRP13569 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFTRP13569 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CFTRP13569 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFTRP13569 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFTRP13569 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CFTRP13569 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFTRP13569 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CFTRP13569 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFTRP13569 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFTRP13569 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFTRP13569 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFTRP13569 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFTRP13569 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFTRP13569 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFTRP13569 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFTRP13569 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFTRP13569 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFTRP13569 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFTRP13569 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFTRP13569 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFTRP13569 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CFTRP13569 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CFTRP13569 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFTRP13569 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CFTRP13569 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFTRP13569 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFTRP13569 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFTRP13569 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFTRP13569 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFTRP13569 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFTRP13569 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFTRP13569 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFTRP13569 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFTRP13569 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFTRP13569 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFTRP13569 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFTRP13569 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFTRP13569 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFTRP13569 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFTRP13569 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFTRP13569 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFTRP13569 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFTRP13569 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFTRP13569 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFTRP13569 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFTRP13569 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CFTRP13569 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFTRP13569 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFTRP13569 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CFTRP13569 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CFTRP13569 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CFTRP13569 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CFTRP13569 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFTRP13569 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFTRP13569 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFTRP13569 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFTRP13569 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFTRP13569 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFTRP13569 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFTRP13569 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFTRP13569 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFTRP13569 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFTRP13569 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFTRP13569 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms