Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOP08100 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOP08100 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOP08100 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOP08100 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOP08100 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOP08100 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOP08100 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOP08100 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOP08100 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOP08100 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOP08100 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOP08100 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOP08100 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOP08100 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOP08100 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOP08100 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOP08100 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOP08100 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOP08100 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOP08100 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOP08100 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOP08100 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOP08100 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOP08100 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOP08100 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOP08100 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOP08100 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOP08100 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOP08100 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOP08100 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOP08100 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOP08100 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOP08100 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOP08100 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOP08100 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOP08100 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOP08100 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOP08100 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOP08100 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOP08100 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOP08100 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOP08100 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOP08100 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOP08100 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOP08100 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOP08100 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOP08100 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOP08100 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOP08100 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOP08100 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOP08100 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOP08100 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOP08100 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOP08100 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOP08100 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOP08100 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOP08100 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOP08100 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOP08100 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOP08100 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOP08100 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOP08100 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOP08100 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOP08100 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOP08100 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOP08100 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOP08100 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOP08100 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOP08100 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOP08100 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOP08100 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOP08100 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOP08100 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOP08100 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOP08100 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOP08100 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOP08100 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOP08100 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOP08100 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOP08100 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOP08100 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOP08100 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOP08100 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOP08100 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOP08100 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOP08100 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOP08100 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOP08100 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOP08100 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOP08100 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOP08100 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOP08100 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOP08100 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOP08100 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOP08100 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOP08100 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOP08100 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOP08100 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOP08100 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms