Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOA4P06727 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
APOA4P06727 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOA4P06727 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOA4P06727 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOA4P06727 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA4P06727 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA4P06727 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA4P06727 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA4P06727 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA4P06727 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA4P06727 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA4P06727 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA4P06727 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA4P06727 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA4P06727 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA4P06727 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA4P06727 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA4P06727 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA4P06727 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA4P06727 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA4P06727 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA4P06727 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA4P06727 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA4P06727 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA4P06727 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA4P06727 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA4P06727 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA4P06727 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA4P06727 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA4P06727 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA4P06727 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA4P06727 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA4P06727 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA4P06727 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA4P06727 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA4P06727 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA4P06727 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA4P06727 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA4P06727 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA4P06727 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA4P06727 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA4P06727 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA4P06727 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA4P06727 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA4P06727 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA4P06727 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA4P06727 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA4P06727 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA4P06727 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOA4P06727 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA4P06727 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA4P06727 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA4P06727 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA4P06727 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA4P06727 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA4P06727 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA4P06727 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA4P06727 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA4P06727 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA4P06727 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA4P06727 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA4P06727 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA4P06727 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA4P06727 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA4P06727 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA4P06727 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA4P06727 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA4P06727 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA4P06727 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA4P06727 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA4P06727 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA4P06727 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA4P06727 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA4P06727 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA4P06727 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA4P06727 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA4P06727 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA4P06727 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA4P06727 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA4P06727 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA4P06727 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA4P06727 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA4P06727 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA4P06727 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA4P06727 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA4P06727 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA4P06727 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA4P06727 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA4P06727 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA4P06727 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA4P06727 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA4P06727 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA4P06727 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA4P06727 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA4P06727 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA4P06727 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA4P06727 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA4P06727 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA4P06727 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms