Protein–RNA interactions for Protein: P05230

FGF1, Fibroblast growth factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF1P05230 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF1P05230 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF1P05230 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF1P05230 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF1P05230 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF1P05230 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF1P05230 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF1P05230 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF1P05230 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF1P05230 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF1P05230 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF1P05230 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF1P05230 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF1P05230 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF1P05230 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF1P05230 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF1P05230 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF1P05230 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF1P05230 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF1P05230 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FGF1P05230 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGF1P05230 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGF1P05230 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGF1P05230 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGF1P05230 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGF1P05230 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGF1P05230 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FGF1P05230 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGF1P05230 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGF1P05230 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGF1P05230 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGF1P05230 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGF1P05230 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGF1P05230 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGF1P05230 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGF1P05230 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGF1P05230 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGF1P05230 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGF1P05230 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGF1P05230 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGF1P05230 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FGF1P05230 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGF1P05230 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGF1P05230 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FGF1P05230 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FGF1P05230 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGF1P05230 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGF1P05230 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FGF1P05230 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGF1P05230 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGF1P05230 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGF1P05230 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FGF1P05230 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGF1P05230 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGF1P05230 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGF1P05230 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGF1P05230 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGF1P05230 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FGF1P05230 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGF1P05230 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGF1P05230 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGF1P05230 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGF1P05230 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGF1P05230 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGF1P05230 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FGF1P05230 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGF1P05230 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGF1P05230 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGF1P05230 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGF1P05230 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGF1P05230 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGF1P05230 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGF1P05230 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGF1P05230 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGF1P05230 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGF1P05230 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGF1P05230 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGF1P05230 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGF1P05230 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGF1P05230 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGF1P05230 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGF1P05230 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGF1P05230 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGF1P05230 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGF1P05230 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGF1P05230 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGF1P05230 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGF1P05230 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGF1P05230 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGF1P05230 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FGF1P05230 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGF1P05230 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGF1P05230 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGF1P05230 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGF1P05230 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGF1P05230 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGF1P05230 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGF1P05230 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGF1P05230 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FGF1P05230 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms