Protein–RNA interactions for Protein: O95803

NDST3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST3O95803 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDST3O95803 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDST3O95803 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDST3O95803 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NDST3O95803 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NDST3O95803 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDST3O95803 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NDST3O95803 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDST3O95803 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDST3O95803 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDST3O95803 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDST3O95803 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDST3O95803 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDST3O95803 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDST3O95803 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDST3O95803 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDST3O95803 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDST3O95803 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDST3O95803 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDST3O95803 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDST3O95803 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDST3O95803 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST3O95803 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST3O95803 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST3O95803 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST3O95803 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST3O95803 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST3O95803 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST3O95803 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST3O95803 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST3O95803 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST3O95803 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST3O95803 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST3O95803 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST3O95803 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST3O95803 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST3O95803 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST3O95803 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST3O95803 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST3O95803 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST3O95803 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST3O95803 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST3O95803 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST3O95803 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST3O95803 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST3O95803 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST3O95803 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST3O95803 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST3O95803 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST3O95803 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST3O95803 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST3O95803 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST3O95803 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST3O95803 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST3O95803 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST3O95803 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST3O95803 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST3O95803 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST3O95803 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST3O95803 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST3O95803 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST3O95803 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST3O95803 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST3O95803 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST3O95803 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST3O95803 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST3O95803 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST3O95803 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST3O95803 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NDST3O95803 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST3O95803 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST3O95803 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST3O95803 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST3O95803 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST3O95803 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST3O95803 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST3O95803 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST3O95803 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST3O95803 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST3O95803 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST3O95803 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST3O95803 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST3O95803 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST3O95803 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST3O95803 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST3O95803 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST3O95803 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST3O95803 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST3O95803 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST3O95803 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST3O95803 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST3O95803 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST3O95803 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST3O95803 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST3O95803 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST3O95803 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST3O95803 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST3O95803 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST3O95803 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDST3O95803 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms