Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD6O43541 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMAD6O43541 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms