Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

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Length 846 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLOCKO15516 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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