Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRTO14522 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRTO14522 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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