Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms