Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID3CA6NKF2 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms