Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MTMR11A4FU01 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms