Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.7 ms