Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9Y3F1 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
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