Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRG3Q9Y2Y8 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms