Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBE1Q9UJT0 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms