Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIMS3Q9UJD0 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms