Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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RNF7Q9UBF6 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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RNF7Q9UBF6 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
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RNF7Q9UBF6 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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RNF7Q9UBF6 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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