Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SLC6A20Q9NP91 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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