Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLXNA4Q9HCM2 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms