Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLSPNQ9HAW4 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms