Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM5DQ9BY66 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms