Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
BRIP1Q9BX63 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms