Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

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Length 2,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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NOTCH4Q99466 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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