Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms